A hólyaggyulladás kezelése jellemzően antibiotikumokkal történik. Ügyelni kell azonban arra, hogy ennek mellékhatásaként, a megváltozott hüvelyflóra miatt ne alakuljanak ki nőgyógyászati jellegű panaszok, például hüvelygyulladás. Ha valaki a nemi élet során vagy gyógyfürdőben kap rendszeresen húgyúti fertőzést, arra is megoldást kell keresni a terápia során.